De Algemene Ledenvergadering (ALV) vertegenwoordigt alle leden van Vee&Logistiek Nederland. Zij geven de uiteindelijke goedkeuring aan het beleid, de jaarplannen, begroting, het jaarverslag en de jaarrekening.
De ledenraad bestaat uit zes leden. Zij controleert namens de leden het bestuur en adviseert de Algemene Ledenvergadering.
Het bestuur bestaat uit de sectorvoorzitters en een onafhankelijke voorzitter. Het bestuur is verantwoordelijk voor het beleid en uitvoering van de organisatie.
Er zijn zeven sectorcommissies:
De sectorcommissies adviseren het bestuur over sectorspecifieke uitvoering van beleid en geven richting aan de uit te voeren activiteiten.
Het secretariaat bestaat uit acht medewerkers. Zij zijn het aanspreekpunt voor de leden en zorgen voor de algemene informatievoorziening. Daarnaast verzorgt het secretariaat de beleidsvoorbereiding en het voert alle plannen en activiteiten uit die voortkomen uit de sectorcommissies en bestuur.